De gemeente Groningen en de Rijksuniversiteit hebben concrete afspraken gemaakt over de komst van de tram zodat wetenschappelijke onderzoeken op het Zernikecomplex niet verstoord worden.
In het verleden zijn ook al afspraken gemaakt, maar deze zijn nu scherper geformuleerd. Dit was nodig omdat de universiteit anders geen grond wilde afstaan voor de tram. Mocht in de toekomst uit onderzoek alsnog blijken dat de eisen van de universiteit onhaalbaar zijn, dan zal de gemeente op zoek gaan naar een alternatieve route voor de tram.
Zernike moet een eindstation worden van de eerste tramlijn. Het Kapteyn Instituut liet daags na het presenteren van de tramroute weten niet blij te zijn met het vervoermiddel. Dit omdat de tram trillingen en magnetische velden zou kunnen veroorzaken en er op Zernike extreem gevoelige apparatuur staat.